¿Cómo calcular la nómina de un trabajador que inicia su relación laboral estando de baja por enfermedad común?

Un trabajador inició su relación laboral en la empresa el 20 de marzo de 2024, sin informarnos que, desde el 15 de enero de 2024, estaba de baja por enfermedad común. Esta situación la descubrimos gracias al fichero SILTRA que recibimos el día siguiente a su alta en la empresa, el 21 de marzo de 2024. A efectos formales, el trabajador estuvo de baja mientras trabajaba, lo cual no supimos debido a su ocultamiento y al retraso en el envío de los partes médicos. ¿Cómo debemos proceder en este caso para calcular su nómina y enviar el certificado correspondiente? Entiendo que debemos calcularle la nómina únicamente con el salario base y las pagas prorrateadas, sin incluir variables, ya que estaba de baja. Además, ¿es necesario tramitar su baja en el sistema RED? Dado que solicita la base del mes anterior y, como hemos mencionado, no hay mes anterior debido a que comenzó a trabajar estando de baja médica. Si ahora mismo consulto el IDC del trabajador, no aparece la baja ni ninguna peculiaridad. La baja la conocimos gracias al fichero FIE que recibimos el jueves, un día después de mecanizar su alta en la Seguridad Social. Cabe destacar que se trata de una enfermedad común, no de paternidad, y no sabemos la causa de esta enfermedad, que podría variar desde una ciática hasta una depresión. Por lo tanto, entiendo que la respuesta puede variar al no ser un caso de paternidad.