¿Cómo funcionan las bonificaciones en los contratos de formación en alternancia?

Tengo varios contratos de formación en alternancia bajo la modalidad de contrato 421 y me surgen un par de dudas que me gustaría aclarar.

En primer lugar, respecto a la bonificación por contrato, que es de 91 € al mes para las cuotas empresariales y de 28 € al mes para las cuotas del trabajador, en nuestro programa de nóminas nos indican que esta bonificación es proporcional a los días de alta. Sin embargo, he consultado con CASIA y me han informado que no es así. A pesar de que la cotización es fija, independientemente de los días en alta, nuestro programa insiste en que sí. Esto me lleva a pensar que podría resultar más caro estar solo 6 días en alta que estar todo el mes.

La otra duda que tengo es sobre la bonificación de tutorización. Entendemos que es obligatorio tener un tutor asignado en este tipo de contratos, lo que implica que todas las empresas deberían poder beneficiarse de esta bonificación. Pero, ¿dónde se aplica exactamente? ¿Es en el seguro social directamente o se gestiona a través de la escuela?