¿Cómo gestionar la jornada laboral de trabajadores fijos discontinuos en dos regímenes diferentes?

Una de las empresas que asesoro tiene dos regímenes laborales: el régimen general y el régimen agrario. Con fecha 01 de mayo, la empresa desea asignar a los trabajadores 4 horas en el régimen general y 4 horas en el régimen agrario. Todos los trabajadores son fijos discontinuos y tienen un contrato 300. He realizado el alta en el régimen agrario, pero en este régimen no me permite añadir jornada. Mi duda es respecto al régimen general: ¿debería comunicar la jornada de trabajo, o es suficiente con hacerlo a nivel de programa de nóminas para que se calcule una base proporcional?