¿Cómo gestionar la liquidación de una trabajadora con alta médica y sin vacaciones suficientes?

Me encuentro en una situación complicada con una trabajadora a la que le han reconocido el alta médica desde el INSS, con fecha de octubre. Ahora, necesito corregir la liquidación de octubre y la de noviembre.

Mi duda es: ¿puedo comunicar este periodo en el sistema RED desde la fecha del alta hasta el momento en que nos lo notifican?

Además, me preocupa que la trabajadora no tiene suficientes vacaciones acumuladas para gestionar esta situación de manera convencional.

Por otro lado, en ocasiones anteriores, nos han solicitado un certificado que indique la fecha de incorporación al trabajo, pero en este caso, la trabajadora no se va a reincorporar.

¿Es responsabilidad de la empresa asumir todos estos costes o existe alguna opción en el sistema RED para manejar esta situación?