¿Cómo gestionar la nómina y la incapacidad permanente de un trabajador que ha agotado los 545 días de baja?

Tengo un trabajador que, desde el 18 de marzo, se encuentra en situación de baja médica tras haber agotado los 545 días de incapacidad temporal. Hasta ahora, nadie ha iniciado el proceso de incapacidad permanente. Me gustaría saber si debo seguir dándole nómina, aunque sea a 0, por los períodos de abril, mayo, etc., hasta que llegue la resolución de incapacidad. Además, en caso de que este trabajador, que ya ha agotado los 545 días, reciba la concesión de incapacidad permanente en unos meses, ¿cómo debo proceder para indicarlo en la TGSS? Específicamente, me gustaría entender cómo gestionar la baja por pase a pensionista con clave 58 y qué sucede con las vacaciones no disfrutadas, que son 45 días.