¿Quién elige el modo de pago de la indemnización en un acto de conciliación por despido improcedente?

Tengo una consulta sobre un acto de conciliación relacionado con un despido improcedente. En este caso, la empresa ha decidido reconocer la improcedencia del despido. Mi duda es sobre quién tiene la autoridad para elegir el modo de pago de la indemnización.
La empresa ha estado pagando siempre en metálico al trabajador, pero ahora plantea la opción de realizar el pago mediante transferencia bancaria. Esto se debe a que tiene conocimiento de que el trabajador tiene sus cuentas embargadas.
¿Es la empresa la que decide el método de pago en este caso, o al haber realizado pagos en metálico anteriormente, este método debería prevalecer?